2004年12月28日，上海外高桥港区海关举行了揭牌仪式。上海外高桥港区海关的前身为上海海关驻外高桥港区办事处，监管范围包括外高桥港区一至五期码头、上海港城危险品仓储有限公司和上海港浦东集装箱物流园区。其监管进出口货值、进出口集装箱量、征收税款等主要业务指标均列上海海关各隶属海关的首位。